Đối tượng thu phí bao gồm các tổ chức, cá nhân được cấp giấy phép thăm dò nước dưới đất; giấy phép khai thác nước dưới đất; giấy phép khai thác nước mặt; giấy phép xả nước thải vào nguồn nước; giấy phép hành nghề khoan nước dưới đất.

Mức thu phí cao nhất là phí thẩm định đề án xả nước thải vào nguồn nước các dự án có lưu lượng từ 20.000 m3/ngày đêm đến dưới 30.000 m3/ngày đêm đối với hoạt động nuôi trồng thủy sản, với mức 14,6 triệu đồng/đề án; thấp nhất là phí thẩm định đề án khai thác, sử dụng nước mặt cho sản xuất nông nghiệp với lưu lượng dưới 0,1 m3/giây và phí thẩm định đề án xả nước thải vào nguồn nước lưu lượng dưới 100 m3/ngày đêm, với mức 600.000 đồng/đề án.

Sở Tài nguyên và Môi trường là cơ quan trực tiếp thu phí trong lĩnh vực tài nguyên nước trên địa bàn tỉnh Bình Dương. Cơ quan trực tiếp thu phí có trách nhiệm niêm yết công khai mức thu phí tại nơi thu phí; cấp biên lai thu cho đối tượng nộp phí theo quy định; thực hiện đăng ký, kê khai, thu, nộp, quyết toán tiền phí thu được theo quy định hiện hành; nộp toàn bộ số tiền phí thu được vào ngân sách nhà nước theo quy định.

Chi phí trang trải cho nhiệm vụ thẩm định hồ sơ, đề án, báo cáo, thu phí do ngân sách nhà nước bố trí trong dự toán chi ngân sách hàng năm của cơ quan trực tiếp thu theo chế độ, định mức chi ngân sách hiện hành.